Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 UBX6YJL048C 1191 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 RBG1YAL036C 1110 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 DIG1YPL049C 1359 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 ACO2YJL200C 2370 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 KDX1YKL161C 1302 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 Q0255Q0255 1419 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 MSB4YOL112W 1479 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 GID8YMR135C 1368 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 HEM13YDR044W 987 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 ATP6Q0085 780 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 BNI5YNL166C 1347 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 GET2YER083C 858 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 YER188WYER188W 720 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 PSD1YNL169C 1503 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 YGR012WYGR012W 1182 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 UBC12YLR306W 567 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 PHO23YNL097C 993 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 PCL10YGL134W 1302 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 MSC1YML128C 1542 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 APT2YDR441C 546 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 FCY21YER060W 1587 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 DMA2YNL116W 1569 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 MRS6YOR370C 1812 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 NAS6YGR232W 687 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 YNL165WYNL165W 1221 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 SDH5YOL071W 489 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 ODC1YPL134C 933 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL1Q12391 FUB1YCR076C 753 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 SFP1YLR403W 2052 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 SSL2YIL143C 2532 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 YGL188CYGL188C 174 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 ARC19YKL013C 516 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 OSH7YHR001W 1314 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 YKL133CYKL133C 1392 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 EEB1YPL095C 1371 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 NDJ1YOL104C 1059 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 RSC4YKR008W 1878 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 CYT1YOR065W 930 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 PEX27YOR193W 1131 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 NPP1YCR026C 2229 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 YJL211CYJL211C 444 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 SED5YLR026C 1023 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 TAF4YMR005W 1167 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 YHR219WYHR219W 1875 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 CSM1YCR086W 573 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 MPS2YGL075C 1164 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 SUA5YGL169W 1281 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 AIM1YAL046C 357 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 TAT2YOL020W 1779 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 COX3Q0275 810 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 MRS3YJL133W 945 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-NL1Q12391 PRY1YJL079C 900 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 NUC1YJL208C 990 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 YOR169CYOR169C 465 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 YHR218WYHR218W 1812 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 GAT1YFL021W 1533 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 YHL008CYHL008C 1884 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 GID7YCL039W 2238 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 DLD3YEL071W 1491 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 MET2YNL277W 1461 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 SIR2YDL042C 1689 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 YLR311CYLR311C 348 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 RAS2YNL098C 969 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 SOL2YCR073W-A 948 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 YLR046CYLR046C 813 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 MRI1YPR118W 1236 nt8.11□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 RAD23YEL037C 1197 nt8.1□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 MDM35YKL053C-A 261 nt8.1□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 CWP2YKL096W-A 279 nt8.1□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 ENT4YLL038C 744 nt8.1□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 CTR1YPR124W 1221 nt8.1□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 LSR1LSR1 1175 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 GPN2YOR262W 1044 nt8.09□□□□□ -1.11
TY1A-NL1Q12391 MMS21YEL019C 804 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 VPS28YPL065W 729 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 LSB5YCL034W 1065 nt8.08□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 SAM3YPL274W 1764 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 GND1YHR183W 1470 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 YDL157CYDL157C 357 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 RRP1YDR087C 837 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 SMM1YNR015W 1155 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 COA2YPL189C-A 207 nt8.07□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 RPD3YNL330C 1302 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 RMA1YKL132C 1293 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 DIA1YMR316W 1011 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 RUF21RUF21 707 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 HXT10YFL011W 1641 nt8.06□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 YDR455CYDR455C 309 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 TIM44YIL022W 1296 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 PZF1YPR186C 1290 nt8.05□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 ITR2YOL103W 1830 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 YHL044WYHL044W 708 nt8.04□□□□□ -1.12
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