Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 DPL1YDR294C 1770 nt8.17□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 KRR1YCL059C 951 nt8.17□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 TIP1YBR067C 633 nt8.17□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 EAF3YPR023C 1206 nt8.17□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 LSB5YCL034W 1065 nt8.16□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 OYE2YHR179W 1203 nt8.15□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 SNX3YOR357C 489 nt8.15□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.14□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 RPT5YOR117W 1305 nt8.13□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 INH1YDL181W 258 nt8.13□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 NSG2YNL156C 900 nt8.13□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 SAC7YDR389W 1965 nt8.13□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 ERG13YML126C 1476 nt8.13□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 LEU4YNL104C 1860 nt8.12□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 LSM5YER146W 282 nt8.11□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 SMM1YNR015W 1155 nt8.11□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 GND1YHR183W 1470 nt8.1□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 PUS7YOR243C 2031 nt8.09□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 MEX67YPL169C 1800 nt8.09□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 RAD23YEL037C 1197 nt8.09□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 YJL118WYJL118W 660 nt8.09□□□□□ -1.11
RBD2Q12270 YLR173WYLR173W 1827 nt8.08□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 TPS1YBR126C 1488 nt8.08□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 FET5YFL041W 1869 nt8.08□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 DDI1YER143W 1287 nt8.07□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 YMR265CYMR265C 1386 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 NPP2YEL016C 1482 nt8.05□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 RRT8YOL048C 1029 nt8.04□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.03□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.03□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 LOT5YKL183W 921 nt8.03□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 TMA23YMR269W 636 nt8.03□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 MIM1YOL026C 342 nt8.03□□□□□ -1.12
RBD2Q12270 CAB5YDR196C 726 nt8.02□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 RIB3YDR487C 627 nt8.02□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 ELO1YJL196C 933 nt8.02□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 YDR467CYDR467C 327 nt8.01□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 HBS1YKR084C 1836 nt8.01□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 YJL055WYJL055W 738 nt8□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 YNR064CYNR064C 873 nt8□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 HAP5YOR358W 729 nt8□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 SUV3YPL029W 2214 nt7.99□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 IMO32YGR031W 1029 nt7.99□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 MDL2YPL270W 2322 nt7.99□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 HXT12YIL170W 1374 nt7.98□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 RPN14YGL004C 1254 nt7.98□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 VRG4YGL225W 1014 nt7.97□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 RIB7YBR153W 735 nt7.97□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 GAL3YDR009W 1563 nt7.97□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.97□□□□□ -1.13
RBD2Q12270 KEL3YPL263C 1956 nt7.95□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 TOM71YHR117W 1920 nt7.95□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 SNU66YOR308C 1764 nt7.94□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 TRP2YER090W 1524 nt7.94□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 DUR3YHL016C 2208 nt7.94□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 ADE8YDR408C 645 nt7.94□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 YJR114WYJR114W 393 nt7.94□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 YLR111WYLR111W 333 nt7.94□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 MTO1YGL236C 2010 nt7.94□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 HXT11YOL156W 1704 nt7.93□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 THI6YPL214C 1623 nt7.92□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 DAK2YFL053W 1776 nt7.92□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 OPI3YJR073C 621 nt7.91□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.91□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 YBL095WYBL095W 813 nt7.91□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 SFL1YOR140W 2301 nt7.9□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 RTG2YGL252C 1767 nt7.9□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 GPM1YKL152C 744 nt7.9□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 CRC1YOR100C 984 nt7.9□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 ORT1YOR130C 879 nt7.9□□□□□ -1.14
RBD2Q12270 ADE2YOR128C 1716 nt7.89□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 TPN1YGL186C 1740 nt7.88□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.87□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 snR31snR31 225 nt7.87□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 SRM1YGL097W 1449 nt7.86□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 AAT1YKL106W 1356 nt7.86□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.86□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 EMC3YKL207W 762 nt7.86□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 FIT1YDR534C 1587 nt7.85□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 SWT21YNL187W 1074 nt7.85□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 MET1YKR069W 1782 nt7.84□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 RIB2YOL066C 1776 nt7.84□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 YMR244WYMR244W 1068 nt7.84□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 snR4snR4 186 nt7.84□□□□□ -1.15
RBD2Q12270 DUS3YLR401C 2007 nt7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.2 ms