Protein–RNA interactions for Protein: Q12140

BSC1, Bypass of stop codon protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BSC1Q12140 PSD1YNL169C 1503 nt8.19□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 CTI6YPL181W 1521 nt8.19□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 RRT8YOL048C 1029 nt8.19□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 ITR2YOL103W 1830 nt8.19□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 DMA2YNL116W 1569 nt8.18□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 ACO2YJL200C 2370 nt8.17□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 ADH7YCR105W 1086 nt8.16□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 CPD1YGR247W 720 nt8.16□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 YJR114WYJR114W 393 nt8.15□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 NME1NME1 340 nt8.15□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 IML3YBR107C 738 nt8.15□□□□□ -1.1
BSC1Q12140 SPS100YHR139C 981 nt8.13□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 PAU15YIR041W 375 nt8.13□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 OPI3YJR073C 621 nt8.13□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 ELO1YJL196C 933 nt8.12□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 TAF13YML098W 504 nt8.12□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 MHF1YOL086W-A 273 nt8.11□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 RPD3YNL330C 1302 nt8.1□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 YMR262WYMR262W 942 nt8.1□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 YNR064CYNR064C 873 nt8.1□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 TIP1YBR067C 633 nt8.1□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 TVP23YDR084C 600 nt8.09□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 TIM44YIL022W 1296 nt8.09□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 CYT1YOR065W 930 nt8.09□□□□□ -1.11
BSC1Q12140 POT1YIL160C 1254 nt8.08□□□□□ -1.12
BSC1Q12140 MDM35YKL053C-A 261 nt8.08□□□□□ -1.12
BSC1Q12140 YHR218WYHR218W 1812 nt8.08□□□□□ -1.12
BSC1Q12140 HXT10YFL011W 1641 nt8.07□□□□□ -1.12
BSC1Q12140 ABZ2YMR289W 1125 nt8.06□□□□□ -1.12
BSC1Q12140 VMA11YPL234C 495 nt8.06□□□□□ -1.12
BSC1Q12140 APS2YJR058C 444 nt8.04□□□□□ -1.12
BSC1Q12140 CWP2YKL096W-A 279 nt8.04□□□□□ -1.12
BSC1Q12140 PAU5YFL020C 369 nt8.03□□□□□ -1.12
BSC1Q12140 SUV3YPL029W 2214 nt8.02□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 SNX3YOR357C 489 nt8.02□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 SFL1YOR140W 2301 nt8.02□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 ENO2YHR174W 1314 nt8.02□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 KEL3YPL263C 1956 nt8.01□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 NIF3YGL221C 867 nt8.01□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 YHL008CYHL008C 1884 nt8□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 YMR265CYMR265C 1386 nt7.99□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.99□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 RPC31YNL151C 756 nt7.99□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 PGC1YPL206C 966 nt7.99□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 AMF1YOR378W 1548 nt7.98□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 TUB4YLR212C 1422 nt7.98□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 DPL1YDR294C 1770 nt7.98□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 TPC1YGR096W 945 nt7.98□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 GSF2YML048W 1212 nt7.98□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 SWT21YNL187W 1074 nt7.98□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 HAP5YOR358W 729 nt7.98□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 MET1YKR069W 1782 nt7.97□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 PCP1YGR101W 1041 nt7.97□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 RIM2YBR192W 1134 nt7.97□□□□□ -1.13
BSC1Q12140 ESS1YJR017C 513 nt7.96□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 CRC1YOR100C 984 nt7.96□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 AGP3YFL055W 1677 nt7.95□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 YKL053WYKL053W 375 nt7.95□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 NAS2YIL007C 663 nt7.94□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 SPE2YOL052C 1191 nt7.94□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 LEU4YNL104C 1860 nt7.94□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 RPN14YGL004C 1254 nt7.93□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 KRE1YNL322C 942 nt7.93□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 STP3YLR375W 1032 nt7.92□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 snR31snR31 225 nt7.91□□□□□ -1.14
BSC1Q12140 NAM8YHR086W 1572 nt7.89□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 MET2YNL277W 1461 nt7.89□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 CDD1YLR245C 429 nt7.89□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 YBR232CYBR232C 360 nt7.89□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 LEU2YCL018W 1095 nt7.89□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 KGD2YDR148C 1392 nt7.88□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 NPP2YEL016C 1482 nt7.87□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 THP3YPR045C 1413 nt7.86□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 YDR467CYDR467C 327 nt7.85□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 IGD1YFR017C 588 nt7.85□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 SAN1YDR143C 1833 nt7.85□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 KRR1YCL059C 951 nt7.84□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 PAR32YDL173W 888 nt7.84□□□□□ -1.15
BSC1Q12140 SFP1YLR403W 2052 nt7.83□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 TPO4YOR273C 1980 nt7.83□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 SRP54YPR088C 1626 nt7.82□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 INH1YDL181W 258 nt7.82□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.82□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.82□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 YKR012CYKR012C 378 nt7.82□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 NBA1YOL070C 1506 nt7.82□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 REX2YLR059C 810 nt7.81□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 PHB2YGR231C 933 nt7.8□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 SEN2YLR105C 1134 nt7.8□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 RPM1RPM1 483 nt7.8□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 ADH3YMR083W 1128 nt7.8□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 FET5YFL041W 1869 nt7.8□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 FRE6YLL051C 2139 nt7.79□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 FSH2YMR222C 672 nt7.79□□□□□ -1.16
BSC1Q12140 SBP1YHL034C 885 nt7.77□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 YJL064WYJL064W 396 nt7.77□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 GPM1YKL152C 744 nt7.77□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 THI3YDL080C 1830 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.76□□□□□ -1.17
BSC1Q12140 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.5 ms