Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 SOL2YCR073W-A 948 nt9.16□□□□□ -0.94
SPE3Q12074 YOR325WYOR325W 474 nt9.16□□□□□ -0.94
SPE3Q12074 DDI1YER143W 1287 nt9.14□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 ACO2YJL200C 2370 nt9.14□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 TMA23YMR269W 636 nt9.12□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 YCR025CYCR025C 411 nt9.11□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 IGD1YFR017C 588 nt9.11□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.11□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.11□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.11□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.11□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 YCP4YCR004C 744 nt9.09□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 NIF3YGL221C 867 nt9.09□□□□□ -0.95
SPE3Q12074 SAM50YNL026W 1455 nt9.08□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 TAT2YOL020W 1779 nt9.07□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 IMO32YGR031W 1029 nt9.06□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 SPS100YHR139C 981 nt9.06□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 DIG1YPL049C 1359 nt9.06□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 YMR209CYMR209C 1374 nt9.04□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 AIM1YAL046C 357 nt9.04□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 ENT4YLL038C 744 nt9.04□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 ADE8YDR408C 645 nt9.03□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 QDR2YIL121W 1629 nt9.02□□□□□ -0.96
SPE3Q12074 IPL1YPL209C 1104 nt9.02□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 ARO8YGL202W 1503 nt9.01□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 LSB6YJL100W 1824 nt9.01□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 TPO4YOR273C 1980 nt9.01□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 YDR455CYDR455C 309 nt9.01□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 RRT8YOL048C 1029 nt9.01□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 SPE2YOL052C 1191 nt9.01□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 BET2YPR176C 978 nt9.01□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 COQ8YGL119W 1506 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 ERG13YML126C 1476 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 NPP1YCR026C 2229 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 HMG2YLR450W 3138 nt9□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 ABZ2YMR289W 1125 nt8.99□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 KES1YPL145C 1305 nt8.99□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 YLR046CYLR046C 813 nt8.98□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 POP2YNR052C 1302 nt8.98□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 ENO2YHR174W 1314 nt8.97□□□□□ -0.97
SPE3Q12074 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.96□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 HIS2YFR025C 1008 nt8.94□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.92□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 NAS2YIL007C 663 nt8.92□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 SGA1YIL099W 1650 nt8.91□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 LYS20YDL182W 1287 nt8.91□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 MOB1YIL106W 945 nt8.91□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 FLX1YIL134W 936 nt8.91□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 RCR1YBR005W 642 nt8.91□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 TVP23YDR084C 600 nt8.9□□□□□ -0.98
SPE3Q12074 UGP1YKL035W 1500 nt8.9□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 GID8YMR135C 1368 nt8.89□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 YMR007WYMR007W 381 nt8.89□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 THP3YPR045C 1413 nt8.88□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 YHL008CYHL008C 1884 nt8.88□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 BUD20YLR074C 501 nt8.88□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 DLD3YEL071W 1491 nt8.86□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.86□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 TPC1YGR096W 945 nt8.86□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 CYC3YAL039C 810 nt8.86□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 SAC7YDR389W 1965 nt8.86□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 ADH3YMR083W 1128 nt8.85□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 YNR064CYNR064C 873 nt8.85□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 FSH2YMR222C 672 nt8.84□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 PSD1YNL169C 1503 nt8.84□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 YKL133CYKL133C 1392 nt8.84□□□□□ -0.99
SPE3Q12074 GID7YCL039W 2238 nt8.83□□□□□ -1
SPE3Q12074 SER2YGR208W 930 nt8.83□□□□□ -1
SPE3Q12074 OPI3YJR073C 621 nt8.83□□□□□ -1
SPE3Q12074 YKR012CYKR012C 378 nt8.83□□□□□ -1
SPE3Q12074 AMF1YOR378W 1548 nt8.82□□□□□ -1
SPE3Q12074 CDD1YLR245C 429 nt8.82□□□□□ -1
SPE3Q12074 RFC1YOR217W 2586 nt8.82□□□□□ -1
SPE3Q12074 SWM1YDR260C 513 nt8.81□□□□□ -1
SPE3Q12074 VMA11YPL234C 495 nt8.81□□□□□ -1
SPE3Q12074 FCY1YPR062W 477 nt8.81□□□□□ -1
SPE3Q12074 ESBP6YNL125C 2022 nt8.81□□□□□ -1
SPE3Q12074 HTS1YPR033C 1641 nt8.8□□□□□ -1
SPE3Q12074 ITR2YOL103W 1830 nt8.8□□□□□ -1
SPE3Q12074 MRS6YOR370C 1812 nt8.8□□□□□ -1
SPE3Q12074 PHB2YGR231C 933 nt8.8□□□□□ -1
SPE3Q12074 YHR219WYHR219W 1875 nt8.8□□□□□ -1
SPE3Q12074 RPD3YNL330C 1302 nt8.79□□□□□ -1
SPE3Q12074 ZAP1YJL056C 2643 nt8.78□□□□□ -1
SPE3Q12074 URA8YJR103W 1737 nt8.78□□□□□ -1
SPE3Q12074 ELO1YJL196C 933 nt8.78□□□□□ -1
SPE3Q12074 LEU2YCL018W 1095 nt8.78□□□□□ -1
SPE3Q12074 KEL3YPL263C 1956 nt8.78□□□□□ -1
SPE3Q12074 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.77□□□□□ -1.01
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