Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 YHR219WYHR219W 1875 nt10.3□□□□□ -0.76
RIM20Q12033 OPI3YJR073C 621 nt10.3□□□□□ -0.76
RIM20Q12033 YJR114WYJR114W 393 nt10.3□□□□□ -0.76
RIM20Q12033 POT1YIL160C 1254 nt10.29□□□□□ -0.76
RIM20Q12033 YKL133CYKL133C 1392 nt10.28□□□□□ -0.76
RIM20Q12033 PAU5YFL020C 369 nt10.27□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 TVP23YDR084C 600 nt10.26□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 LSR1LSR1 1175 nt10.26□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 HIS2YFR025C 1008 nt10.25□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.25□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 ESS1YJR017C 513 nt10.25□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 APS2YJR058C 444 nt10.25□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 PGC1YPL206C 966 nt10.25□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 RIM8YGL045W 1629 nt10.25□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 ELO1YJL196C 933 nt10.23□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 YNR064CYNR064C 873 nt10.23□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 NIF3YGL221C 867 nt10.22□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 ABZ2YMR289W 1125 nt10.21□□□□□ -0.77
RIM20Q12033 GSF2YML048W 1212 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM20Q12033 YGL114WYGL114W 2178 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM20Q12033 TUB4YLR212C 1422 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM20Q12033 STP3YLR375W 1032 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM20Q12033 TIP1YBR067C 633 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM20Q12033 SSL2YIL143C 2532 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM20Q12033 SFL1YOR140W 2301 nt10.15□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 VMA11YPL234C 495 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 YBR232CYBR232C 360 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 SUV3YPL029W 2214 nt10.13□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 ENO2YHR174W 1314 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 RPD3YNL330C 1302 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 ODC1YPL134C 933 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 KEL3YPL263C 1956 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 AMF1YOR378W 1548 nt10.11□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 TPC1YGR096W 945 nt10.1□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 PCP1YGR101W 1041 nt10.1□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 NAS2YIL007C 663 nt10.1□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 RPM1RPM1 483 nt10.1□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 SWT21YNL187W 1074 nt10.1□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 YMR209CYMR209C 1374 nt10.09□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 YMR265CYMR265C 1386 nt10.09□□□□□ -0.79
RIM20Q12033 CDD1YLR245C 429 nt10.08□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 SNX3YOR357C 489 nt10.08□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 MET1YKR069W 1782 nt10.07□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 SPE2YOL052C 1191 nt10.07□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 HAP5YOR358W 729 nt10.07□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 KRE1YNL322C 942 nt10.05□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 CRC1YOR100C 984 nt10.05□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 PAR32YDL173W 888 nt10.04□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 TIM44YIL022W 1296 nt10.04□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 CWP2YKL096W-A 279 nt10.04□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 SEN2YLR105C 1134 nt10.04□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 YKL053WYKL053W 375 nt10.03□□□□□ -0.8
RIM20Q12033 IGD1YFR017C 588 nt10.02□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 RIM2YBR192W 1134 nt10□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 NAM8YHR086W 1572 nt10□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 THP3YPR045C 1413 nt9.99□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 RPN14YGL004C 1254 nt9.99□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 LEU2YCL018W 1095 nt9.99□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 YJL064WYJL064W 396 nt9.98□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 RPC31YNL151C 756 nt9.98□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 snR31snR31 225 nt9.98□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 DPL1YDR294C 1770 nt9.97□□□□□ -0.81
RIM20Q12033 MDM35YKL053C-A 261 nt9.95□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 DMA2YNL116W 1569 nt9.94□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 KGD2YDR148C 1392 nt9.94□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 PHB2YGR231C 933 nt9.93□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 ADH3YMR083W 1128 nt9.93□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 HEL2YDR266C 1920 nt9.93□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 SAN1YDR143C 1833 nt9.92□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 YKR012CYKR012C 378 nt9.91□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 FSH2YMR222C 672 nt9.91□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 REX2YLR059C 810 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 PAU19YMR325W 375 nt9.9□□□□□ -0.82
RIM20Q12033 SRP54YPR088C 1626 nt9.89□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 KRR1YCL059C 951 nt9.89□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 NAP1YKR048C 1254 nt9.87□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 PUP1YOR157C 786 nt9.87□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 IPL1YPL209C 1104 nt9.87□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 LEU4YNL104C 1860 nt9.86□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 HXT10YFL011W 1641 nt9.85□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 SDS24YBR214W 1584 nt9.85□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 FLX1YIL134W 936 nt9.85□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 PSD1YNL169C 1503 nt9.85□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 MOB1YIL106W 945 nt9.84□□□□□ -0.83
RIM20Q12033 YHR218WYHR218W 1812 nt9.83□□□□□ -0.84
RIM20Q12033 VBA3YCL069W 1377 nt9.83□□□□□ -0.84
RIM20Q12033 SBP1YHL034C 885 nt9.8□□□□□ -0.84
RIM20Q12033 THI3YDL080C 1830 nt9.79□□□□□ -0.84
RIM20Q12033 YDR467CYDR467C 327 nt9.78□□□□□ -0.84
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