Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMPCAQ10713 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCAQ10713 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCAQ10713 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMPCAQ10713 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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