Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prelid2Q0VBB0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prelid2Q0VBB0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prelid2Q0VBB0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prelid2Q0VBB0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prelid2Q0VBB0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prelid2Q0VBB0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prelid2Q0VBB0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prelid2Q0VBB0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prelid2Q0VBB0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prelid2Q0VBB0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid2Q0VBB0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid2Q0VBB0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prelid2Q0VBB0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prelid2Q0VBB0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prelid2Q0VBB0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms