Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ubxn2bQ0KL01 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ubxn2bQ0KL01 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ubxn2bQ0KL01 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ubxn2bQ0KL01 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ubxn2bQ0KL01 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ubxn2bQ0KL01 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ubxn2bQ0KL01 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ubxn2bQ0KL01 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubxn2bQ0KL01 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ubxn2bQ0KL01 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Ubxn2bQ0KL01 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ubxn2bQ0KL01 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Ubxn2bQ0KL01 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ubxn2bQ0KL01 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ubxn2bQ0KL01 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ubxn2bQ0KL01 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Ubxn2bQ0KL01 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ubxn2bQ0KL01 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ubxn2bQ0KL01 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ubxn2bQ0KL01 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ubxn2bQ0KL01 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ubxn2bQ0KL01 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ubxn2bQ0KL01 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ubxn2bQ0KL01 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ubxn2bQ0KL01 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ubxn2bQ0KL01 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ubxn2bQ0KL01 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ubxn2bQ0KL01 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ubxn2bQ0KL01 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms