Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Znf541Q0GGX2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Znf541Q0GGX2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Znf541Q0GGX2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Znf541Q0GGX2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Znf541Q0GGX2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Znf541Q0GGX2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Znf541Q0GGX2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Znf541Q0GGX2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Znf541Q0GGX2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Znf541Q0GGX2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Znf541Q0GGX2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Znf541Q0GGX2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Znf541Q0GGX2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Znf541Q0GGX2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Znf541Q0GGX2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Znf541Q0GGX2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Znf541Q0GGX2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Znf541Q0GGX2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Znf541Q0GGX2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Znf541Q0GGX2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Znf541Q0GGX2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Znf541Q0GGX2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Znf541Q0GGX2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Znf541Q0GGX2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Znf541Q0GGX2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Znf541Q0GGX2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Znf541Q0GGX2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Znf541Q0GGX2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Znf541Q0GGX2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Znf541Q0GGX2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Znf541Q0GGX2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Znf541Q0GGX2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Znf541Q0GGX2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Znf541Q0GGX2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Znf541Q0GGX2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Znf541Q0GGX2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Znf541Q0GGX2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Znf541Q0GGX2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Znf541Q0GGX2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Znf541Q0GGX2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms