Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RBL2Q08999 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBL2Q08999 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBL2Q08999 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBL2Q08999 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RBL2Q08999 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms