Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD47Q08722 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD47Q08722 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD47Q08722 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD47Q08722 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD47Q08722 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD47Q08722 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD47Q08722 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD47Q08722 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD47Q08722 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD47Q08722 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD47Q08722 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD47Q08722 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CD47Q08722 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD47Q08722 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD47Q08722 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD47Q08722 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD47Q08722 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD47Q08722 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD47Q08722 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD47Q08722 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD47Q08722 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD47Q08722 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD47Q08722 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD47Q08722 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD47Q08722 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD47Q08722 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD47Q08722 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD47Q08722 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD47Q08722 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD47Q08722 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD47Q08722 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD47Q08722 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD47Q08722 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD47Q08722 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD47Q08722 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD47Q08722 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD47Q08722 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD47Q08722 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD47Q08722 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD47Q08722 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD47Q08722 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD47Q08722 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD47Q08722 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD47Q08722 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD47Q08722 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD47Q08722 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CD47Q08722 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD47Q08722 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD47Q08722 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD47Q08722 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD47Q08722 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD47Q08722 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD47Q08722 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD47Q08722 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD47Q08722 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD47Q08722 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD47Q08722 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD47Q08722 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD47Q08722 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD47Q08722 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD47Q08722 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD47Q08722 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD47Q08722 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD47Q08722 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD47Q08722 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD47Q08722 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD47Q08722 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD47Q08722 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD47Q08722 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD47Q08722 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD47Q08722 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD47Q08722 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD47Q08722 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD47Q08722 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD47Q08722 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD47Q08722 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD47Q08722 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD47Q08722 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD47Q08722 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD47Q08722 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD47Q08722 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD47Q08722 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD47Q08722 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD47Q08722 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD47Q08722 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD47Q08722 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD47Q08722 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD47Q08722 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD47Q08722 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD47Q08722 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CD47Q08722 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD47Q08722 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD47Q08722 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD47Q08722 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD47Q08722 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD47Q08722 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD47Q08722 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD47Q08722 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD47Q08722 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms