Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbp2Q08652 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp2Q08652 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbp2Q08652 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp2Q08652 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp2Q08652 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms