Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfdp1Q08639 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfdp1Q08639 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tfdp1Q08639 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tfdp1Q08639 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tfdp1Q08639 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfdp1Q08639 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tfdp1Q08639 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tfdp1Q08639 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.2 ms