Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4F3Q08477 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP4F3Q08477 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP4F3Q08477 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP4F3Q08477 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP4F3Q08477 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms