Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXL1Q08397 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXL1Q08397 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXL1Q08397 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXL1Q08397 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXL1Q08397 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXL1Q08397 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXL1Q08397 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXL1Q08397 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXL1Q08397 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LOXL1Q08397 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXL1Q08397 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXL1Q08397 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL1Q08397 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL1Q08397 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms