Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN3Q08043 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN3Q08043 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN3Q08043 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN3Q08043 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN3Q08043 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms