Protein–RNA interactions for Protein: Q08003

RFU1, Regulator of free ubiquitin chains 1, yeastyeast

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RFU1Q08003 LSM5YER146W 282 nt7.68□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 LSB6YJL100W 1824 nt7.68□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 AIM1YAL046C 357 nt7.67□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 CYT1YOR065W 930 nt7.67□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 THI6YPL214C 1623 nt7.67□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 HIS2YFR025C 1008 nt7.66□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 ENT4YLL038C 744 nt7.66□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 TAT2YOL020W 1779 nt7.66□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 RTG2YGL252C 1767 nt7.65□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 FUN14YAL008W 597 nt7.65□□□□□ -1.18
RFU1Q08003 DDI1YER143W 1287 nt7.64□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 TMA23YMR269W 636 nt7.64□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 YLR046CYLR046C 813 nt7.63□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 PCP1YGR101W 1041 nt7.62□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 SGA1YIL099W 1650 nt7.62□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 LPD1YFL018C 1500 nt7.62□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 YDR455CYDR455C 309 nt7.61□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 YEL008WYEL008W 381 nt7.6□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 UGP1YKL035W 1500 nt7.6□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 CCT5YJR064W 1689 nt7.6□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 MAS1YLR163C 1389 nt7.59□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 MEX67YPL169C 1800 nt7.59□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 DUR3YHL016C 2208 nt7.59□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 IMO32YGR031W 1029 nt7.59□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 RRT8YOL048C 1029 nt7.59□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 ERG13YML126C 1476 nt7.59□□□□□ -1.19
RFU1Q08003 GCD11YER025W 1584 nt7.59□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 GID8YMR135C 1368 nt7.59□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 DAK2YFL053W 1776 nt7.58□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 GNP1YDR508C 1992 nt7.57□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 ADE8YDR408C 645 nt7.56□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 STE4YOR212W 1272 nt7.55□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 YPR126CYPR126C 309 nt7.55□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 SNZ1YMR096W 894 nt7.54□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 SNU66YOR308C 1764 nt7.54□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 UFD1YGR048W 1086 nt7.53□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 IML3YBR107C 738 nt7.53□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 YKL133CYKL133C 1392 nt7.53□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 DLD3YEL071W 1491 nt7.53□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 ADE2YOR128C 1716 nt7.52□□□□□ -1.2
RFU1Q08003 DMA2YNL116W 1569 nt7.52□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 YJR114WYJR114W 393 nt7.52□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 TAF13YML098W 504 nt7.52□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 MRS6YOR370C 1812 nt7.5□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 TIP1YBR067C 633 nt7.5□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 CTI6YPL181W 1521 nt7.49□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 YNR064CYNR064C 873 nt7.49□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 MHF1YOL086W-A 273 nt7.49□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 VMA11YPL234C 495 nt7.49□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 CPD1YGR247W 720 nt7.48□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 SPS100YHR139C 981 nt7.48□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 YHR219WYHR219W 1875 nt7.48□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 YLR349WYLR349W 507 nt7.48□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 ECM10YEL030W 1935 nt7.48□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 RPD3YNL330C 1302 nt7.48□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 SAC7YDR389W 1965 nt7.48□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 ZAP1YJL056C 2643 nt7.48□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 LSR1LSR1 1175 nt7.47□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 ITR2YOL103W 1830 nt7.47□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.47□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 YHR218WYHR218W 1812 nt7.46□□□□□ -1.21
RFU1Q08003 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.46□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 MAM3YOL060C 2121 nt7.46□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 TVP23YDR084C 600 nt7.45□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 POT1YIL160C 1254 nt7.45□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 CWP2YKL096W-A 279 nt7.45□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 ADH7YCR105W 1086 nt7.44□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 OPI3YJR073C 621 nt7.44□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 ODC1YPL134C 933 nt7.44□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 YRF1-2YER190W 5046 nt7.44□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 TIM44YIL022W 1296 nt7.43□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 ELO1YJL196C 933 nt7.43□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 ABZ2YMR289W 1125 nt7.43□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 SSL2YIL143C 2532 nt7.42□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 FIT1YDR534C 1587 nt7.42□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 KEL3YPL263C 1956 nt7.41□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 RPN14YGL004C 1254 nt7.41□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 SNX3YOR357C 489 nt7.41□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 KRR1YCL059C 951 nt7.4□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 YMR262WYMR262W 942 nt7.4□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 YMR265CYMR265C 1386 nt7.4□□□□□ -1.22
RFU1Q08003 ENO2YHR174W 1314 nt7.39□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 PAU15YIR041W 375 nt7.39□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 HAP5YOR358W 729 nt7.39□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 snR31snR31 225 nt7.39□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 GSF2YML048W 1212 nt7.38□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 MET30YIL046W 1923 nt7.37□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.37□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 MDM35YKL053C-A 261 nt7.37□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 AMF1YOR378W 1548 nt7.37□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 RAD51YER095W 1203 nt7.36□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 RPC31YNL151C 756 nt7.36□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 TUB4YLR212C 1422 nt7.35□□□□□ -1.23
RFU1Q08003 SWT21YNL187W 1074 nt7.33□□□□□ -1.24
RFU1Q08003 YNL190WYNL190W 615 nt7.33□□□□□ -1.24
RFU1Q08003 SUV3YPL029W 2214 nt7.32□□□□□ -1.24
RFU1Q08003 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.31□□□□□ -1.24
RFU1Q08003 KRE1YNL322C 942 nt7.31□□□□□ -1.24
RFU1Q08003 RIM2YBR192W 1134 nt7.31□□□□□ -1.24
RFU1Q08003 YEL023CYEL023C 2049 nt7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.6 ms