Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SOS1Q07889 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SOS1Q07889 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SOS1Q07889 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SOS1Q07889 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SOS1Q07889 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SOS1Q07889 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms