Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
COL16A1Q07092 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
COL16A1Q07092 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
COL16A1Q07092 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37■■■■□ 3.51
COL16A1Q07092 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
COL16A1Q07092 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
COL16A1Q07092 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
COL16A1Q07092 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
COL16A1Q07092 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
COL16A1Q07092 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
COL16A1Q07092 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
COL16A1Q07092 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
COL16A1Q07092 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
COL16A1Q07092 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
COL16A1Q07092 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
COL16A1Q07092 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
COL16A1Q07092 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
COL16A1Q07092 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
COL16A1Q07092 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
COL16A1Q07092 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
COL16A1Q07092 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
COL16A1Q07092 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
COL16A1Q07092 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
COL16A1Q07092 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
COL16A1Q07092 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
COL16A1Q07092 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
COL16A1Q07092 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
COL16A1Q07092 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
COL16A1Q07092 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
COL16A1Q07092 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
COL16A1Q07092 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
COL16A1Q07092 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
COL16A1Q07092 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
COL16A1Q07092 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
COL16A1Q07092 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
COL16A1Q07092 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
COL16A1Q07092 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
COL16A1Q07092 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
COL16A1Q07092 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
COL16A1Q07092 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
COL16A1Q07092 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
COL16A1Q07092 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
COL16A1Q07092 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
COL16A1Q07092 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
COL16A1Q07092 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
COL16A1Q07092 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
COL16A1Q07092 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
COL16A1Q07092 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
COL16A1Q07092 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
COL16A1Q07092 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
COL16A1Q07092 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
COL16A1Q07092 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
COL16A1Q07092 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
COL16A1Q07092 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
COL16A1Q07092 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
COL16A1Q07092 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
COL16A1Q07092 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
COL16A1Q07092 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
COL16A1Q07092 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
COL16A1Q07092 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
COL16A1Q07092 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
COL16A1Q07092 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
COL16A1Q07092 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
COL16A1Q07092 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
COL16A1Q07092 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
COL16A1Q07092 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
COL16A1Q07092 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
COL16A1Q07092 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
COL16A1Q07092 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms