Protein–RNA interactions for Protein: Q06413

MEF2C, Myocyte-specific enhancer factor 2C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEF2CQ06413 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEF2CQ06413 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEF2CQ06413 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEF2CQ06413 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEF2CQ06413 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms