Protein–RNA interactions for Protein: Q06210

GFPT1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFPT1Q06210 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GFPT1Q06210 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GFPT1Q06210 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GFPT1Q06210 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GFPT1Q06210 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GFPT1Q06210 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GFPT1Q06210 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GFPT1Q06210 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GFPT1Q06210 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GFPT1Q06210 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GFPT1Q06210 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms