Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITIH3Q06033 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITIH3Q06033 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITIH3Q06033 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITIH3Q06033 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITIH3Q06033 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITIH3Q06033 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITIH3Q06033 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms