Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox13Q04891 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox13Q04891 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox13Q04891 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sox13Q04891 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox13Q04891 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox13Q04891 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox13Q04891 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms