Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNEQ04844 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNEQ04844 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNEQ04844 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNEQ04844 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1185.4 ms