Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMX1Q04741 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMX1Q04741 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMX1Q04741 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMX1Q04741 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMX1Q04741 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms