Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kcnb1Q03717 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcnb1Q03717 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kcnb1Q03717 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcnb1Q03717 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kcnb1Q03717 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnb1Q03717 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnb1Q03717 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnb1Q03717 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnb1Q03717 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnb1Q03717 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcnb1Q03717 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcnb1Q03717 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kcnb1Q03717 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnb1Q03717 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnb1Q03717 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnb1Q03717 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms