Protein–RNA interactions for Protein: Q03288

Asip, Agouti-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsipQ03288 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AsipQ03288 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AsipQ03288 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AsipQ03288 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AsipQ03288 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AsipQ03288 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AsipQ03288 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AsipQ03288 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AsipQ03288 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AsipQ03288 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AsipQ03288 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AsipQ03288 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AsipQ03288 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AsipQ03288 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AsipQ03288 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AsipQ03288 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AsipQ03288 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms