Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hivep1Q03172 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hivep1Q03172 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hivep1Q03172 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hivep1Q03172 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hivep1Q03172 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hivep1Q03172 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hivep1Q03172 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hivep1Q03172 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hivep1Q03172 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hivep1Q03172 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hivep1Q03172 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Hivep1Q03172 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hivep1Q03172 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hivep1Q03172 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms