Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddr1Q03146 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddr1Q03146 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddr1Q03146 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddr1Q03146 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddr1Q03146 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddr1Q03146 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms