Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epha4Q03137 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Epha4Q03137 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epha4Q03137 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epha4Q03137 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epha4Q03137 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epha4Q03137 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epha4Q03137 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epha4Q03137 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epha4Q03137 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epha4Q03137 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Epha4Q03137 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Epha4Q03137 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha4Q03137 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms