Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU3F1Q03052 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU3F1Q03052 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU3F1Q03052 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU3F1Q03052 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU3F1Q03052 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU3F1Q03052 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU3F1Q03052 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU3F1Q03052 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU3F1Q03052 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU3F1Q03052 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POU3F1Q03052 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU3F1Q03052 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms