Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLOD1Q02809 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLOD1Q02809 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD1Q02809 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLOD1Q02809 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLOD1Q02809 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLOD1Q02809 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms