Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GscQ02591 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GscQ02591 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GscQ02591 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GscQ02591 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GscQ02591 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GscQ02591 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GscQ02591 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GscQ02591 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GscQ02591 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GscQ02591 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GscQ02591 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GscQ02591 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GscQ02591 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GscQ02591 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GscQ02591 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GscQ02591 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GscQ02591 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GscQ02591 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GscQ02591 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GscQ02591 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GscQ02591 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GscQ02591 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GscQ02591 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GscQ02591 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GscQ02591 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GscQ02591 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GscQ02591 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GscQ02591 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GscQ02591 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GscQ02591 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GscQ02591 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GscQ02591 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GscQ02591 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GscQ02591 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GscQ02591 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GscQ02591 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GscQ02591 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GscQ02591 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GscQ02591 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GscQ02591 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GscQ02591 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GscQ02591 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GscQ02591 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GscQ02591 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GscQ02591 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GscQ02591 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GscQ02591 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GscQ02591 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GscQ02591 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GscQ02591 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GscQ02591 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GscQ02591 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GscQ02591 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GscQ02591 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GscQ02591 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GscQ02591 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GscQ02591 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GscQ02591 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GscQ02591 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GscQ02591 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GscQ02591 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GscQ02591 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GscQ02591 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GscQ02591 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GscQ02591 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GscQ02591 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GscQ02591 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GscQ02591 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GscQ02591 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GscQ02591 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GscQ02591 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GscQ02591 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GscQ02591 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GscQ02591 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GscQ02591 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GscQ02591 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GscQ02591 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GscQ02591 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GscQ02591 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GscQ02591 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GscQ02591 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GscQ02591 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GscQ02591 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GscQ02591 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GscQ02591 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GscQ02591 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GscQ02591 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GscQ02591 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GscQ02591 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GscQ02591 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GscQ02591 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GscQ02591 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GscQ02591 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GscQ02591 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GscQ02591 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GscQ02591 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GscQ02591 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GscQ02591 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GscQ02591 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms