Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nhlh1Q02576 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nhlh1Q02576 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nhlh1Q02576 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nhlh1Q02576 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nhlh1Q02576 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nhlh1Q02576 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nhlh1Q02576 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nhlh1Q02576 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nhlh1Q02576 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nhlh1Q02576 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhlh1Q02576 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nhlh1Q02576 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nhlh1Q02576 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhlh1Q02576 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms