Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL18AQ02543 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL18AQ02543 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL18AQ02543 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL18AQ02543 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms