Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APBA1Q02410 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APBA1Q02410 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
APBA1Q02410 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APBA1Q02410 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APBA1Q02410 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APBA1Q02410 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APBA1Q02410 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APBA1Q02410 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA1Q02410 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA1Q02410 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
APBA1Q02410 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APBA1Q02410 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APBA1Q02410 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms