Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHODHQ02127 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DHODHQ02127 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHODHQ02127 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DHODHQ02127 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHODHQ02127 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHODHQ02127 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHODHQ02127 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHODHQ02127 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHODHQ02127 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHODHQ02127 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHODHQ02127 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHODHQ02127 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHODHQ02127 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms