Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Gja5Q01231 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gja5Q01231 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gja5Q01231 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gja5Q01231 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Gja5Q01231 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gja5Q01231 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gja5Q01231 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gja5Q01231 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gja5Q01231 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gja5Q01231 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gja5Q01231 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gja5Q01231 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gja5Q01231 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gja5Q01231 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gja5Q01231 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gja5Q01231 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gja5Q01231 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gja5Q01231 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gja5Q01231 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gja5Q01231 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gja5Q01231 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gja5Q01231 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gja5Q01231 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gja5Q01231 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Gja5Q01231 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gja5Q01231 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gja5Q01231 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gja5Q01231 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gja5Q01231 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gja5Q01231 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gja5Q01231 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gja5Q01231 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gja5Q01231 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gja5Q01231 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Gja5Q01231 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gja5Q01231 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gja5Q01231 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gja5Q01231 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gja5Q01231 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gja5Q01231 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gja5Q01231 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gja5Q01231 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gja5Q01231 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Gja5Q01231 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms