Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa1Q00623 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apoa1Q00623 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apoa1Q00623 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apoa1Q00623 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apoa1Q00623 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apoa1Q00623 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms