Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSF1Q00613 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSF1Q00613 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HSF1Q00613 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSF1Q00613 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSF1Q00613 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms