Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP11AP98196 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP11AP98196 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11AP98196 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11AP98196 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP11AP98196 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP11AP98196 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP11AP98196 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP11AP98196 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11AP98196 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11AP98196 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11AP98196 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP11AP98196 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP11AP98196 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP11AP98196 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP11AP98196 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP11AP98196 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP11AP98196 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP11AP98196 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11AP98196 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP11AP98196 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP11AP98196 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP11AP98196 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms