Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps45P97390 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps45P97390 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps45P97390 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps45P97390 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps45P97390 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps45P97390 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps45P97390 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps45P97390 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps45P97390 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps45P97390 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps45P97390 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps45P97390 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps45P97390 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps45P97390 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps45P97390 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps45P97390 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps45P97390 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps45P97390 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps45P97390 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps45P97390 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps45P97390 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps45P97390 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps45P97390 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps45P97390 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps45P97390 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 344.3 ms