Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Psme1P97371 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Psme1P97371 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Psme1P97371 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Psme1P97371 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Psme1P97371 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Psme1P97371 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Psme1P97371 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Psme1P97371 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Psme1P97371 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Psme1P97371 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Psme1P97371 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Psme1P97371 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Psme1P97371 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Psme1P97371 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Psme1P97371 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Psme1P97371 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Psme1P97371 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Psme1P97371 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Psme1P97371 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Psme1P97371 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Psme1P97371 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Psme1P97371 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Psme1P97371 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Psme1P97371 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Psme1P97371 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Psme1P97371 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Psme1P97371 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Psme1P97371 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Psme1P97371 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Psme1P97371 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Psme1P97371 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Psme1P97371 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Psme1P97371 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Psme1P97371 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Psme1P97371 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Psme1P97371 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Psme1P97371 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Psme1P97371 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Psme1P97371 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Psme1P97371 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Psme1P97371 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Psme1P97371 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Psme1P97371 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Psme1P97371 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Psme1P97371 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Psme1P97371 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Psme1P97371 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Psme1P97371 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Psme1P97371 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Psme1P97371 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Psme1P97371 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Psme1P97371 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Psme1P97371 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms