Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx2P81066 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx2P81066 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx2P81066 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx2P81066 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx2P81066 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx2P81066 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx2P81066 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx2P81066 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx2P81066 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx2P81066 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx2P81066 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx2P81066 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx2P81066 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx2P81066 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Irx2P81066 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx2P81066 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx2P81066 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx2P81066 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx2P81066 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx2P81066 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms