Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CiitaP79621 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CiitaP79621 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CiitaP79621 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CiitaP79621 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CiitaP79621 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CiitaP79621 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CiitaP79621 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CiitaP79621 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CiitaP79621 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CiitaP79621 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CiitaP79621 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CiitaP79621 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CiitaP79621 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CiitaP79621 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CiitaP79621 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CiitaP79621 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CiitaP79621 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CiitaP79621 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CiitaP79621 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CiitaP79621 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CiitaP79621 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CiitaP79621 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CiitaP79621 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CiitaP79621 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CiitaP79621 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CiitaP79621 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CiitaP79621 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CiitaP79621 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CiitaP79621 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CiitaP79621 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms