Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT85P78386 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT85P78386 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT85P78386 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT85P78386 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT85P78386 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KRT85P78386 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KRT85P78386 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KRT85P78386 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KRT85P78386 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KRT85P78386 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KRT85P78386 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT85P78386 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT85P78386 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT85P78386 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KRT85P78386 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KRT85P78386 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT85P78386 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT85P78386 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT85P78386 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT85P78386 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT85P78386 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT85P78386 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRT85P78386 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRT85P78386 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KRT85P78386 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KRT85P78386 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT85P78386 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KRT85P78386 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KRT85P78386 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KRT85P78386 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT85P78386 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT85P78386 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT85P78386 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT85P78386 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT85P78386 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT85P78386 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT85P78386 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT85P78386 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT85P78386 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT85P78386 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT85P78386 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT85P78386 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT85P78386 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT85P78386 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT85P78386 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT85P78386 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT85P78386 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT85P78386 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT85P78386 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT85P78386 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT85P78386 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT85P78386 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT85P78386 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT85P78386 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT85P78386 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT85P78386 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT85P78386 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT85P78386 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT85P78386 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT85P78386 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT85P78386 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT85P78386 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT85P78386 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT85P78386 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT85P78386 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KRT85P78386 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT85P78386 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT85P78386 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT85P78386 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT85P78386 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT85P78386 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT85P78386 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT85P78386 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT85P78386 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT85P78386 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT85P78386 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT85P78386 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT85P78386 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT85P78386 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT85P78386 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT85P78386 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT85P78386 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT85P78386 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT85P78386 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT85P78386 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT85P78386 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT85P78386 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT85P78386 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT85P78386 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT85P78386 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT85P78386 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT85P78386 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT85P78386 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT85P78386 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT85P78386 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT85P78386 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT85P78386 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT85P78386 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT85P78386 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.5 ms