Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT83P78385 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT83P78385 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT83P78385 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT83P78385 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT83P78385 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT83P78385 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT83P78385 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT83P78385 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT83P78385 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT83P78385 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT83P78385 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT83P78385 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT83P78385 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT83P78385 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT83P78385 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT83P78385 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT83P78385 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT83P78385 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT83P78385 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT83P78385 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT83P78385 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT83P78385 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT83P78385 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT83P78385 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT83P78385 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT83P78385 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT83P78385 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT83P78385 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT83P78385 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT83P78385 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT83P78385 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT83P78385 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT83P78385 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT83P78385 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT83P78385 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT83P78385 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT83P78385 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT83P78385 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT83P78385 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT83P78385 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT83P78385 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT83P78385 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT83P78385 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT83P78385 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT83P78385 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT83P78385 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT83P78385 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT83P78385 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT83P78385 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT83P78385 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT83P78385 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT83P78385 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT83P78385 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT83P78385 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT83P78385 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT83P78385 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT83P78385 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT83P78385 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT83P78385 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT83P78385 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT83P78385 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT83P78385 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT83P78385 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT83P78385 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT83P78385 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT83P78385 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT83P78385 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT83P78385 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT83P78385 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT83P78385 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT83P78385 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT83P78385 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT83P78385 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT83P78385 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT83P78385 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT83P78385 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT83P78385 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT83P78385 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT83P78385 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT83P78385 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT83P78385 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT83P78385 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT83P78385 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT83P78385 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT83P78385 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT83P78385 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT83P78385 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT83P78385 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT83P78385 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT83P78385 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT83P78385 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KRT83P78385 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KRT83P78385 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT83P78385 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT83P78385 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT83P78385 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT83P78385 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT83P78385 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT83P78385 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms