Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms