Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shox2P70390 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shox2P70390 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shox2P70390 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shox2P70390 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shox2P70390 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shox2P70390 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shox2P70390 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shox2P70390 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shox2P70390 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shox2P70390 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shox2P70390 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shox2P70390 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shox2P70390 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shox2P70390 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shox2P70390 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shox2P70390 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shox2P70390 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shox2P70390 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shox2P70390 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shox2P70390 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shox2P70390 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shox2P70390 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shox2P70390 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shox2P70390 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shox2P70390 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shox2P70390 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shox2P70390 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shox2P70390 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shox2P70390 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shox2P70390 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shox2P70390 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shox2P70390 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shox2P70390 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Shox2P70390 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shox2P70390 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shox2P70390 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shox2P70390 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shox2P70390 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shox2P70390 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shox2P70390 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms