Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4fP70194 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4fP70194 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clec4fP70194 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4fP70194 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clec4fP70194 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec4fP70194 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec4fP70194 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec4fP70194 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec4fP70194 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clec4fP70194 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec4fP70194 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms